{"id":722,"date":"2021-05-10T16:20:46","date_gmt":"2021-05-10T21:20:46","guid":{"rendered":"https:\/\/insurgentepress.mx\/?p=722"},"modified":"2021-05-10T16:20:48","modified_gmt":"2021-05-10T21:20:48","slug":"egresados-buap-contribuyen-a-la-creacion-del-catalogo-mas-grande-de-variacion-genomica-de-grupos-nativos-mexicanos","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/insurgentepress.mx\/index.php\/2021\/05\/10\/egresados-buap-contribuyen-a-la-creacion-del-catalogo-mas-grande-de-variacion-genomica-de-grupos-nativos-mexicanos\/","title":{"rendered":"Egresados BUAP contribuyen a la creaci\u00f3n del cat\u00e1logo m\u00e1s grande de variaci\u00f3n gen\u00f3mica de grupos nativos mexicanos"},"content":{"rendered":"\n<ul class=\"wp-block-list\"><li><strong>El art\u00edculo\u00a0<em>Whole genome variation in 27 mexican indigenous populations, demographic and biomedical insights<\/em>\u00a0-en el cual son coautores exalumnos de Biomedicina y Biotecnolog\u00eda- fue publicado en la revista Plos One<\/strong><\/li><\/ul>\n\n\n\n<p>Agencias, Ciudad de M\u00e9xico.- En un trabajo conjunto entre el Instituto de Biotecnolog\u00eda de la UNAM y el Instituto Nacional de Medicina Gen\u00f3mica, ex alumnos de la BUAP fueron part\u00edcipes de un importante proyecto de investigaci\u00f3n, mediante el cual se cre\u00f3 el cat\u00e1logo m\u00e1s grande, a la fecha, de variaci\u00f3n gen\u00f3mica de grupos ind\u00edgenas de M\u00e9xico.<\/p>\n\n\n\n<p>En esta investigaci\u00f3n, cuyos resultados fueron publicados en el art\u00edculo&nbsp;<em>Whole genome variation in 27 mexican indigenous populations, demographic and biomedical insights<\/em>, en la revista Plos One, los egresados de las licenciaturas en Biomedicina, de la Facultad de Medicina, Israel Aguilar Ordo\u00f1ez, y de Biotecnolog\u00eda, de la Facultad de Ciencias Biol\u00f3gicas, Judith Ballesteros Villasc\u00e1n y Ram Gonz\u00e1lez Buenfil, realizaron el an\u00e1lisis de los genomas completos de 100 individuos de 27 grupos ind\u00edgenas del pa\u00eds, de las regiones norte, centro y sur.<\/p>\n\n\n\n<blockquote class=\"wp-block-quote is-layout-flow wp-block-quote-is-layout-flow\"><p>\u201cEstudiamos la composici\u00f3n gen\u00f3mica completa de cerca de 100 individuos de 27 diferentes grupos ind\u00edgenas de M\u00e9xico. Esto nos permiti\u00f3 tener un conocimiento muy detallado de la variaci\u00f3n gen\u00f3mica de los pobladores originales de nuestro pa\u00eds, hasta ahora poco estudiados gen\u00f3micamente\u201d, se\u00f1al\u00f3 Israel Aguilar, primer autor del citado art\u00edculo y quien co-dirigi\u00f3 las tesis de licenciatura de Judith Ballesteros y Ram Gonz\u00e1lez, importantes para la conclusi\u00f3n del proyecto.<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n<p>La secuenciaci\u00f3n de los genomas completos de los 27 grupos originarios de M\u00e9xico report\u00f3 cerca de 10 millones de variantes gen\u00f3micas, varias de estas con efectos en mecanismos de inmunidad que muy probable fueron seleccionadas naturalmente. Entre estas, 44 mil variantes antes no reportadas.<\/p>\n\n\n\n<p>En dicha investigaci\u00f3n -considerada por los egresados BUAP como un primer paso para nuevos estudios que conduzcan a una medicina gen\u00f3mica de prevenci\u00f3n- \u201cuna caracter\u00edstica muy interesante es que los genomas de estos grupos tienen menor recombinaci\u00f3n gen\u00e9tica (haplotipos largos) que la mayor parte de los grupos hasta ahora estudiados. Esto puede ser resultado de cuellos de botella poblacionales a lo largo de su historia evolutiva, antigua y reciente\u201d, refiri\u00f3 Aguilar Ordo\u00f1ez.<\/p>\n\n\n\n<p>Adem\u00e1s, se encontr\u00f3 una clara diferenciaci\u00f3n entre los grupos del norte, centro y sureste del pa\u00eds, lo que puede indicar la existencia de marcadores gen\u00e9ticos espec\u00edficos de las diferentes regiones del pa\u00eds. Los ind\u00edgenas peruanos est\u00e1n cerca gen\u00e9ticamente de los grupos de M\u00e9xico, particularmente de los Mayas, agreg\u00f3.<\/p>\n\n\n\n<blockquote class=\"wp-block-quote is-layout-flow wp-block-quote-is-layout-flow\"><p>\u201cEl conocimiento obtenido con los genomas completos de este estudio es fundamental para poder implementar la medicina gen\u00f3mica de precisi\u00f3n en nuestro pa\u00eds, as\u00ed como tener una mejor comprensi\u00f3n de la historia demogr\u00e1fica y evolutiva de estas poblaciones\u201d, se\u00f1al\u00f3 Israel Aguilar, quien actualmente estudia el Doctorado en Ciencias Bioqu\u00edmicas en la UNAM, donde enfoca sus estudios al an\u00e1lisis masivo de datos p\u00fablicamente disponibles para impulsar el avance de la medicina gen\u00f3mica.<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n<p>En su opini\u00f3n, esta secuenciaci\u00f3n es de gran importancia, ya que a la fecha hay miles de genomas europeos y asi\u00e1ticos, lo cual no ocurre con la poblaci\u00f3n mexicana, lo que deriva en un problema de subrepresentaci\u00f3n de algunos grupos poblaciones. Con esta investigaci\u00f3n se llena un vac\u00edo al incluir genomas completos de la poblaci\u00f3n mexicana en el acervo mundial.<\/p>\n\n\n\n<p><strong>Estudiantes BUAP, vocaci\u00f3n por la ciencia<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>El citado proyecto de investigaci\u00f3n entre el Instituto Nacional de Medicina Gen\u00f3mica (INMEGEN) y el Instituto de Biotecnolog\u00eda de la UNAM, que inici\u00f3 hacia finales de 2014, re\u00fane a 13 investigadores, entre estos los egresados de la BUAP de las licenciaturas en Biomedicina, Israel Aguilar Ordo\u00f1ez, y de Biotecnolog\u00eda, Judith Ballesteros Villasc\u00e1n \u2013quien particip\u00f3 con la tesis \u201cDesarrollo de una herramienta bioinform\u00e1tica para el an\u00e1lisis poblacional de la variaci\u00f3n gen\u00f3mica\u201d\u2013 y Ram Gonz\u00e1lez Buenfil \u2013 con \u201cAn\u00e1lisis de la variaci\u00f3n gen\u00e9tica en regiones enhancer de genomas de poblaci\u00f3n nativa mexicana\u201d \u2013.<\/p>\n\n\n\n<p>Durante su estancia de investigaci\u00f3n en el INMEGEN, Judith Ballesteros comenz\u00f3 su participaci\u00f3n con el an\u00e1lisis de datos de las variantes gen\u00f3micas y la b\u00fasqueda bibliogr\u00e1fica sobre estas.<\/p>\n\n\n\n<blockquote class=\"wp-block-quote is-layout-flow wp-block-quote-is-layout-flow\"><p>\u201cEncontramos alrededor de 10 millones de variantes, muchas de inter\u00e9s biom\u00e9dico, nos enfocamos a catalogar aquellas que ten\u00edan una asociaci\u00f3n estad\u00edstica con alg\u00fan fenotipo particular, con ciertas caracter\u00edsticas. Sin embargo, no podemos establecer conclusiones directas con los fenotipos que estudiamos. M\u00e1s bien, podemos hablar de datos o resultados interesantes que nos permiten generar nuevas hip\u00f3tesis\u201d, expres\u00f3.<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n<p>Luego de explicar que los genomas se dividen en dos regiones: las que codifican para prote\u00ednas, una porci\u00f3n peque\u00f1a, contienen nuestros genes; y las que no codifican, entre estas los reguladores que median qu\u00e9 genes se apagan o se activan, tambi\u00e9n en qu\u00e9 cantidad se activan o no, Ram Gonz\u00e1lez Buenfil precis\u00f3 que durante su estancia en el INMEGEN su trabajo consisti\u00f3 en determinar y delimitar lo que hay en estos reguladores no codificantes.<\/p>\n\n\n\n<p>\u201cEncontramos variantes en ellas. Entonces delimitamos lo que hay en esas regiones no codificantes y encontramos resultados interesantes: hay un tipo de elemento regulador, llamado potenciador, que entra en contacto con otro elemento promotor \u2013que se encuentra antes del gen\u2013 y favorece la activaci\u00f3n de este gen o prote\u00edna que codifica\u201d.<\/p>\n\n\n\n<p>Entre estas variantes posiblemente reguladoras, existe una que atrajo mayor atenci\u00f3n: una variante que cae en un potenciador de PPAR-gamma, gen que se encarga de mediar procesos metab\u00f3licos y procesamiento de l\u00edpidos en el cuerpo. Se ha encontrado que mutaciones que ocurren directamente en el gen est\u00e1n asociadas a diversas enfermedades, como la resistencia a insulina. \u201cNosotros encontramos estas variantes en un elemento que regula este gen, y aunque desconocemos el efecto que puedan tener sobre la expresi\u00f3n, estas variantes presentan una se\u00f1al de selecci\u00f3n, que es como un indicio de que est\u00e1n sujetas a un proceso adaptativo o evolutivo. A\u00fan no sabemos por qu\u00e9, pero es interesante ese indicio, adem\u00e1s asociado a este gen tan particular con reportes previos de mutaciones en padecimientos importantes\u201d.<\/p>\n\n\n\n<p>Finalmente, el estudiante de la Maestr\u00eda en Biolog\u00eda Integrativa del CINVESTAV-Langebio, al igual que Judith Ballesteros, precis\u00f3 que la frecuencia con la que ocurren algunas de estas variantes es mayor en estas poblaciones ind\u00edgenas, que en otras, pero a\u00fan es prematuro hacer conclusiones sobre los efectos que pudieran tener: si favorecen o no la activaci\u00f3n del gen que regulan, o si son neutrales.<\/p>\n\n\n\n<p>De un total de 68 grupos originarios, a la fecha ha sido secuenciado el genoma completo de 31 grupos \u00e9tnicos, de los cuales el consorcio detr\u00e1s del proyecto aport\u00f3 27, destac\u00f3 Israel Aguilar.<\/p>\n\n\n\n<blockquote class=\"wp-block-quote is-layout-flow wp-block-quote-is-layout-flow\"><p>\u201cEstos proyectos son acumulativos, la historia no empieza con esto, ni se acaba, pero s\u00ed dejamos una piedrita en la escalera para continuar, al aportar estas variantes o particularidades que dan cuenta de tu historia, qui\u00e9nes son tu familia, de d\u00f3nde vienen. En suma: la historia de nuestros ancestros\u201d, expres\u00f3.<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n<p>Al mismo tiempo resalt\u00f3 la trascendencia de estas investigaciones para la evoluci\u00f3n de la medicina gen\u00f3mica, preventiva y personalizada, que tendr\u00e1 sin duda un gran impacto en la salud p\u00fablica.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>En un trabajo conjunto entre el Instituto de Biotecnolog\u00eda de la UNAM y el Instituto Nacional de Medicina Gen\u00f3mica, ex alumnos de la BUAP fueron part\u00edcipes de un importante proyecto de investigaci\u00f3n, mediante el cual se cre\u00f3 el cat\u00e1logo m\u00e1s grande, a la fecha, de variaci\u00f3n gen\u00f3mica de grupos ind\u00edgenas de M\u00e9xico.<\/p>\n","protected":false},"author":3,"featured_media":723,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[4],"tags":[],"class_list":["post-722","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-estados"],"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/insurgentepress.mx\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/722","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/insurgentepress.mx\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/insurgentepress.mx\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/insurgentepress.mx\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/3"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/insurgentepress.mx\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=722"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/insurgentepress.mx\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/722\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":724,"href":"https:\/\/insurgentepress.mx\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/722\/revisions\/724"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/insurgentepress.mx\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media\/723"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/insurgentepress.mx\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=722"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/insurgentepress.mx\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=722"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/insurgentepress.mx\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=722"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}